Die Thomas-Gemeinde wird von einer Gemeindeleitung geleitet. Sie besteht aus sechs Personen, wovon vier ehrenamtliche Mitarbeiter sind und zwei unsere hauptamtlichen Pastoren. Die ehrenamtlichen Mitarbeiter, werden alle vier Jahre von den Gemeindemitgliedern in ihren Dienst hineingewählt.
Die Gemeindeleitung hat es als Aufgabe die Gemeinde, sowohl geistlich als auch strukturell und organisatorisch zu leiten. Dabei ist sie immer wieder im Gespräch mit den Gemeindemitgliedern.